Começou sua carreira como atacante, mas em uma partida, quando ainda era da equipe júnior, foi testado como volante e se saiu muito bem. Foi quando decidiu mudar de posição. Em sua primeira partida como titular pelo Corinthians, contra o Botafogo, onde atuou no lugar do zagueiro Zelão que estava suspenso, acabou fazendo um gol contra nos primeiros minutos da partida. Porém, aos 25 minutos do segundo tempo, Nílton corrigiu seu erro marcando um gol de fora da área. Nílton é conhecido pelo seu empenho em campo, sua determinação, sua raça e sua garra. Seu chute forte é sua marca registrada, e cada dia mais vem ganhando a admiração dos adeptos do Vasco da Gama.No ano de 2009, jogando pelo clube carioca, Nílton foi eleito o melhor segundo volante do campeonato carioca depois de excelentes atuações.

Em setembro de 2010, durante uma partida válida pelo Campeonato Brasileiro contra o Guarani, Nilton se machucou e saiu sentindo o joelho. Posteriormente, soube que havia sofrido uma ruptura do ligamento do joelho. Com a lesão, ficará afastado por 6 meses e só voltará a jogar em 2011.