Você tem conhecimento mesmo sobre o assunto ou você também é um leigo querendo explicar sobre o tema para leigos?

Nem de longe a única prova que vale é aquela produzida nos autos. A maior fonte probatória das ações penais é o inquérito policial e ele não é produzido durante o processo 'nos autos', como você diz.

A perícia realizada por um assistente técnico contratado (durante o processo) pela acusação ou da defesa é plenamente válida e será devidamente valorada pelo juiz.

Realizar uma perícia prévia pode ter grande influência e até corroborar com outras provas que levem ao pedido de arquivamento do inquérito policial pelo MP, sem sequer iniciar o processo.

Ademais, atualmente não é raro que ocorra a investigação criminal defensiva, concomitante as investigações pela Polícia Civil, sendo realizada pelo próprio acusado em busca da reunião de provas que provem sua inocência, como ocorreu no caso do Neymar vs Najila, por exemplo.