Gilsinho começou sua carreira como profissional em 2003 no Marilia. Após rodar por times do interior do estado se transferiu para o futebol japonês. Foram 4 temporadas defendendo o Jubilo Iwata, onde apresentou um bom futebol.

No inicio de 2012 foi contratado pelo Timão, onde integrou o elenco campeão da Copa Libertadores. Teve algumas oportunidades com a camisa corintiana, mas não agradou. Após uma passagem de apenas 6 meses com 17 jogos e um único gol rescindiu seu contrato com o Corinthians.

Após uma breve passagem pelo Sport, o atacante retornou ao futebol japonês, pelo Ventforet Kofu. Chegou a voltar para o país natal e defendeu o Audax, mas retornou ao país oriental novamente, pelo Gifu.

Sem se firmar em nenhum clube, Gilsinho retornou ao Brasil, com passagens por Ferroviária, Mirassol e Botafogo-SP e está no Atlético-GO desde o início de 2019.