Formado na base do Corinthians, Matheus Caldeira foi campeão da Copa São Paulo de Futebol Junior em 2012. Nessa ocasião aconteceu um episódio bizarro, o futuro presidente da CBF José Marin roubou uma medalha da competição, fazendo com que o goleiro corintiano ficasse sem a sua.

Atualmente, ele integra o grupo do Corinthians. Sendo a quarta o opção para o gol do Timão. Em dezembro de 2014, recebeu sua primeira convocação para a Seleção Brasileira Sub-20.

Em 2016, Matheus Vidotto fez seu primeiro jogo oficial pelo Corinthians. Na ocasião, o atleta teve a chance quando Cássio e Walter estavam machucados. O Timão enfrentou o São Bento, em Sorocaba.

Em 2017, foi afastado do elenco por um ato de indisciplina e passou a não fazer mais parte dos planos da equipe. Com isso, em 2019, assinou pelo Figueirense e defende a meta do time catarinense.