Depois da carreira de jogador, Basílio decidiu se tornar treinador. Ele teve quatro passagens como treinador do Corinthians, totalizando 116 jogos.

A primeira passagem foi como interino, em 1985 em um jogo contra o São Paulo pelo Campeonato Paulista. Pouco depois, em 1987, assumiu o Corinthians depois da demissão de Jorge Vieira, mais uma vez como interino, até a chegada de Formiga. Entre 1989 em 1990, teve sua primeira passagem como técnico efetivo, e em 1992 fez sua última temporada no comando do Corinthians, sendo demitido após a derrota por 4 a 0 diante do Internacional, pela Copa do Brasil.